Después de la actualización del wordpress a la 2.6 he tenido un problema con los permalinks. Me devolvía un error de página (error 404) inexistente o no mostraba el contenido, la solución momentánea fue volver a la estructura antigua de links que tenia el wordpress ya sabes:
http://www.esunbichito.com/blog/?cat=6 en contra de la que tenemos actualmente http://www.esunbichito.com/blog/index.php/como-solucionar-el-error-404-de-wordpress-con-los-permalinks/

había encontrado una solución momentánea y muy simple.
dentro del menú: opciones -> permalinks abajado del todo hay un apartado Opcional que dice Categoría base y Etiqueta base lo rellenamos con cualquier palabra que tenga sentido en nuestro blog. Pero la cosa no me convencía porque la estructura del link quedaba un poco liada, así que la descarte, después de mucho buscar por foros en españoles y ingleses he encontrado la solución dentro de la misma página de wordpress.

http://trac.wordpress.org/changeset/8365

la solución consiste en modificar los siguientes archivos:
/wp-admin/options-permalink.php
/wp-includes/rewrite.php
/wp-includes/version.php

De la forma que lo indica hay que sustituir el color rojo por el verde que es el correcto, con esto el problema quedara solucionado mucho antes que llegue la versión 2.6.1 de wordpress que seguramente solucionara este bug que lo categorizaron como critico y es reiterado desde la beta de la versión 2.6